由不祥的彗星“Repulse”所引导，被封印于“黄金的苹果”之内的纠纷女神艾莉丝重新降临大地。艾莉丝依附于在星矢长大的孤儿院“星之子学园”里工作的少女“相泽绘梨衣”的肉体上，并掳走了身为雅典娜的城户纱织，企图通过吸取雅典娜的精气而完全复活。在前往营救雅典娜的星矢等青铜圣斗士的面前等待着的是，借艾莉丝的魔力从死亡世界苏醒过来的“亡灵圣斗士（Ghost Saint）”们。赌上大地命运和雅典娜的性命，青铜圣斗士VS亡灵圣斗士的激战，如今开幕。